Jan Sas Zubrzycki do końca życia był aktywnym i wziętym architektem. W jego twórczości architektonicznej przeważało budownictwo sakralne, w którym dopatrywał się symbolicznego wyrazu prawd wiary chrześcijańskiej. Starał się eksponować chrześcijańskiego ducha polskiego narodu, który według niego najlepiej wyrażał się w stylu gotyckim charakterystycznym dla Krakowa i Polski południowej, a większość elementów tego stylu wywodził z dawnej słowiańskiej ciesiołki. Wypracował własny, oryginalny, neogotycki styl architektoniczny, który nazywał Stylem nadwiślańskim, łączącym motywy romańskie i gotyckie, i w tym stylu zaprojektował większość swoich budowli. Po 1912 roku, kiedy przeniósł się na stałe do Lwowa, w jego twórczości architektonicznej pojawiają się nowe elementy – motywy zaczerpnięte z polskiego renesansu. Jan Sas Zubrzycki projektował także świeckie budowle użyteczności publicznej i budynki na zamówienia prywatne, w których stosował z zamiłowaniem średniowieczne motywy architektoniczne – ceglane elewacje z wyraźnym detalem.

Wieloletnia działalność architektoniczna przyniosła bardzo bogaty plon. Na terenie Małopolski wybudowano ponad 40 kościołów i jedną cerkiew według projektów Jana Sasa Zubrzyckiego a około 20 przebudowano lub odnowiono.

Oto Jego naważniejsze dzieła architektoniczne:

Obiekty sakralne wybudowane:

• Szczurowa (1893)
  • Trześniów (1898)
  • Lubcza (1899)
  • Błażowa (1900)
  • Cieklin (1903)
  • Ciężkowice (1903)
  • Bruśnik (1904)
  • Nowy Sącz-Biegonice (1904)
  • Zaleszany (1905)
  • Poręba Radlna (1905)
  • Tarnów (1906)
  • Piotrkowice (1907)
  • Kraków-Podgórze – kościół redemptorystów (1907)
  • Bielcza (1908)
  • Kraków-Podgórze – kościół św. Józefa (1909) 
  • Grobla (1909)
  • Jadowniki Podgórne (1910)
  • Trzebinia – kościół Salwatorianów (1911)
  • Siedliska-Bogusz (1912)
  • Górno (1913)
  • Jordanów (1913)
  • Kasinka Mała (1913)
  • Sokołów Małopolski (1914)
  • Szczepanów (1914)
  • Porąbka Uszewska (1918)
  • Czortków – kościół Dominikanów (1918)
  • Lubatowa (1921)
  • Łężkowice (1921)
  • Żeleźnikowa (1921)
  • Niewodna (1923)
  • Wietrzychowice (1924)
  • Jedlicze (1925)
  • Otfinów (1929)
  • Lwów – kościół Kapucynów (1930)
  • Łapczyca (1933)
  • Tłuste (1934)
  • Miejsce Piastowe – kościół Michalitów „Na Górce” (1935)
  • Suków (1937)
  • Masłów Pierwszy (1938)
  • Ryglice (1940)

Obiekty przebudowane 

• • Bochnia (1905)
  • Borzęcin – kościół Narodzenia Najświętszej Maryi Panny (1905)
  • Szczucin (1905)
  • Trzciana koło Bochni (1907)
  • Tarnobrzeg, kościół Dominikanów (1909)

Obiekty świeckie

• • Rymanów – pensjonat „Pod Matką Boską”, pierwszy projekt Sasa-Zubrzyckiego (1884)
  • Myślenice – ratusz (1889)
  • Kraków – trzy kamienice: ul. Kurniki 3 (1892), al. Słowackiego 7 (1895), ul. Św. Filipa 25 (1898)
  • Niepołomice – ratusz (1903)
  • Zator – ratusz (1903)
  • Brzozów – hala Towarzystwa Gimnastycznego „Sokół” (1910)
  • Jordanów– ratusz (1911)
  • Jedlicze – rezydencja rodu Stawiarskich (1925)